Dovrebbe derivare dal toponimo Moliterno (PZ) ed indicare il paese di origine della famiglia.
Il cognome Moliterni è tipico della zona che comprende la Basilicata ed il barese.
Moliterno sembra avere anche due ceppi secondari, nel barese e nel napoletano.
Il cognome Moliterni è 293° nella regione Basilicata Il cognome Moliterni è 167° nella provincia di Matera Il cognome Moliterni è 1° nel comune di TOLVE (PZ)