Dovrebbe derivare direttamente o tramite ipocoristici da soprannomi originati dal vocabolo arabo mu'arraf (liberto, che è stato ammaestrato o liberato dalla schiavitù).
Il cognome Marraffa ha un grosso nucleo pugliese nella zona delle province di Taranto e Brindisi, uno nel salernitano, uno nel cosentino e nel reggino ed in Sicilia soprattutto nel salernitano. Marraffini, molto raro, è del teatino. Marraffino ha un ceppo tra napoletano, casertano e la provincia di Campobasso, un ceppo nel potentino ed uno nel catanese.
Il cognome Marraffino è 1323° nella regione Molise Il cognome Marraffino è 916° nella provincia di Campobasso Il cognome Marraffino è 13° nel comune di VOLTURARA APPULA (FG)