Dovrebbe derivare da un soprannome dialettale originato dal termine maraglio, "ammiraglio, comandante".
Il cognome Maraglino è decisamente pugliese, della provincia di Taranto e di Massafra in particolare, ma ben presente anche a Noci nel barese. Maraglini è praticamente unico e sembrerebbe dovuto ad un'errata trascrizione del precedente.
Il cognome Maraglino è 1590° nella regione Puglia Il cognome Maraglino è 189° nella provincia di Taranto Il cognome Maraglino è 2° nel comune di MASSAFRA (TA)