Dovrebbe derivare da modificazioni del nome di origini ebraiche Malachia.
Un'altra ipotesi lo lega ad una forma contratta del termine malacitanus, "abitante della città di Malaca", l'attuale Malaga, città del sud della Spagna.
I cognomi Malacchi, forse emiliano/romagnolo, e Malacco, veneto, sono rarissimi.
Il cognome Malacco è 14219° nella regione Veneto Il cognome Malacco è 5365° nella provincia di Treviso Il cognome Malacco è 164° nel comune di SAN MARTINO DI LUPARI (PD)