Deriva dal nome biblico Isaiah (significa "Dio è salvezza").
Il cognome Isaia ha due ceppi, nel catanese e nel cuneese. Isaja,Isaija e Isajia, rari, sembrano specifici della Sicilia orientale.
Il cognome Isaja è 4354° nella regione Sicilia Il cognome Isaja è 1039° nella provincia di Messina Il cognome Isaja è 28° nel comune di NIZZA DI SICILIA (ME)