Dovrebbe derivare dal nome medioevale Giugnus, presente a Pisa già nel 1200, oppure dal nomen latino Junius, nome portato ad esempio dal senatore romano Marcus Junius Brutus (83 - 45 a.C.) Caesaris interfector.
Il cognome Giugno sembra avere molti ceppi, nel bresciano, nella provincia romana, nel casertano e napoletano, in Puglia, in Calabria ed in Sicilia.
Il cognome Giugno è 1142° nella regione Sicilia Il cognome Giugno è 70° nella provincia di Caltanissetta Il cognome Giugno è 9° nel comune di NISCEMI (CL)