Potrebbe derivare dal nome del capostipite composto da Giovanni (contratto in Gianni) e Tommaso.
Il cognome Giantomasi sembra essere specifico del beneventano. Giantomaso è anch'esso del beneventano e anche del vicino foggiano. Giantommasi è praticamente unico ed è probabilmente dovuto ad errori di trascrizione così come Giantommaso.