Potrebbe derivare da un soprannome originato da una forma ipocoristica originata dal termine veneto ganassa, "guancia, mascella", forse ad indicare che i capostipiti fossero delle buone forchette e fossero soliti mangiare in modo abbondante, o anche che avessero delle gote paffute.
Il cognome Ganassin è tipicamente veneto, del vicentino e del trevigiano. Ganassini, più raro, è del veronese.
Il cognome Ganassin è 3054° nella regione Veneto Il cognome Ganassin è 812° nella provincia di Vicenza Il cognome Ganassin è 37° nel comune di BERTIOLO (UD)