Potrebbe derivare da un soprannome che indicava la provenienza del capostipite da paesi come Fratta di Fossalta di Portogruaro, o Accoppè Fratte nel veneziano, Fratta di Oderzo, o di Tarzo, o Fratte nel trevisano, o Fratta nel pordenonese.
Con il termine italiano fratta si indica un luogo impraticabile, scosceso, ricco di arbusti, e quindi il termine potrebbe semplicemente indicare che la famiglia abitava in una località con queste caratteristiche.
Il cognome Fratter, abbastanza raro, è tipico del veneziano con ramificazioni anche nel trevisano.
Il cognome Fratter è 5570° nella regione Veneto Il cognome Fratter è 1659° nella provincia di Venezia Il cognome Fratter è 12° nel comune di PRAMAGGIORE (VE)