Potrebbe derivare dall'unione del termine latino frater, "fratello", ma anche "frate" aggiunto al nome Antonius.
Il cognome Fratantuono ha un ceppo molisano e nel potentino. Fratantoni sembrerebbe siciliano, del ragusano e del messinese.
Il cognome Fratantoni è 5186° nella regione Sicilia Il cognome Fratantoni è 813° nella provincia di Ragusa Il cognome Fratantoni è 36° nel comune di REITANO (ME)