Dovrebbe derivare da soprannomi legati al significato simbolico attribuito alla fonte intesa come sorgente di spiritualità o di purezza di sentimenti oppure da toponimi quali Fontana (PR) - (NA), Fontana di Montella (AV), Fontana Liri (FR), Fontana Pradosa (PC), Fontanella (BG), Fontanelle (CE) e moltissimi altri.
Il cognome Fontana è assolutamente panitaliano, ma più diffuso al nord. Fontanazza è tipico della provincia di Enna. Fontanazzi è del modenese.
Il cognome Fontani è 251° nella regione Toscana Il cognome Fontani è 63° nella provincia di Siena Il cognome Fontani è 4° nel comune di RADICONDOLI (SI)