Potrebbe derivare da un soprannome attribuito ai capostipiti, originato dal termine veneziano arcaico fòfano, "goffo, malfatto", oppure da ipocoristici di nomi come Cristofano, Cristofalo o Cristofolo.
Il cognome Foffano è tipico del veneziano con un ceppo anche nel trevisano. Foffani, rarissimo, è del padovano. Fofano, quasi unico, è veneziano.