Dovrebbe derivare, direttamente o tramite ipocoristici, da un'alterazione del cognomen latino Faesonius, Fesonius, o anche del cognomen Fessius.
Il cognome Fisanotti è piemontese e sembrerebbe originario del torinese. Fisani, Fisano e Fissani, sono praticamente unici.
Il cognome Fisanotti è 1991° nella regione Valle d'Aosta Il cognome Fisanotti è 708° nella provincia di Sud Sardegna Il cognome Fisanotti è 8° nel comune di CALUSO (TO)