Dovrebbe derivare da un soprannome basato sul termine logudorese depere, "dovere".
Il cognome Deperu ha un piccolo ceppo nel sassarese ed in Gallura. De Peru, praticamente unico, è decisamente sardo.
Il cognome Deperu è 2306° nella regione Sardegna Il cognome Deperu è 1003° nella provincia di Sassari Il cognome Deperu è 38° nel comune di PERFUGAS (SS)