Dovrebbe derivare da un soprannome di mestiere originato dal vocabolo dialettale cuttuni, ossia "cotone". Veniva utilizzato pertanto per indicare una persona o una famiglia addetta alla coltivazione, impiego o commercio del cotone.
Il cognome Cottone è tipicamente siciliano così come Cottoni che però è molto raro. Cotone è piuttosto raro mentre Cotoni è quasi unico.
Il cognome Cottone è 346° nella regione Sicilia Il cognome Cottone è 211° nella provincia di Palermo Il cognome Cottone è 5° nel comune di LIBRIZZI (ME)