Potrebbe derivare dall'aferesi di nomi come Anicito, nome ad esempio dell'undicesimo Papa oppure potrebbe essere una variante tarantina e brindisina del cognome Zito dall'appellativo zito, "fidanzato" che corrisponde all'antico italiano citto, "ragazzo".
Il cognome Cito è tipicamente pugliese, con un piccolo ceppo anche nel napoletano.