La sua origine etimologica è oscura, ma si ipotizza una derivazione da un soprannome dialettale locale basato sul termine spagnolo chica, "ragazza".
Il cognome Ciquera, molto raro, sembrerebbe pugliese, con piccoli ceppi nel barese e nel tarentino.
Il cognome Ciquera è 6599° nella regione Puglia Il cognome Ciquera è 2013° nella provincia di Taranto Il cognome Ciquera è 50° nel comune di SAMMICHELE DI BARI (BA)