Potrebbe derivare da soprannomi legati al fatto che una cicogna nidificasse sulla casa del capostipite, o derivati da toponimi come Cicognara (MN) o Cicognolo (CR).
Il cognome Cicogna è sparso nella penisola ed ha un sicuro ceppo veneto, ed uno umbro, ma potrebbe essercene uno anche nel milanese. Cicognini è del centro sud della Lombardia. Cigognini è proprio del milanese e del lodigiano.
Il cognome Cigognini è 3474° nella regione Lombardia Il cognome Cigognini è 156° nella provincia di Lodi Il cognome Cigognini è 13° nel comune di IZANO (CR)