Dovrebbe derivare dal toponimo Binago della provincia di Como.
Il cognome Binaghi è tipico del nordmilanese, varesotto e comasco. Binago è quasi unico.
Il cognome Binaghi è 2444° nella regione Lombardia Il cognome Binaghi è 767° nella provincia di Varese Il cognome Binaghi è 3° nel comune di POGGIO CATINO (RI)