Potrebbe derivare dal nome medioevale Benuccius di cui si hanno tracce già nel 1200 in Toscana.
Tracce di queste cognomizzazioni si trovano a Rovigno in Istria fin dal 1300 con la famiglia Benussi.
Il cognome Benucci è tipicamente toscano, del fiorentino in particolare. Benussi sembrerebbe triestino.