Dovrebbe derivare da una modificazione del cognomen latino Balbus (Balbi).
Il cognome Balboni è tipico emiliano, della zona che comprende le province di Modena, Bologna e Ferrara. Balbini è rarissimo.
Il cognome Balboni è 43° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Balboni è 2° nella provincia di Ferrara Il cognome Balboni è 1° nel comune di CENTO (FE)