Potrebbe derivare dal nome medioevale di origine germanica Arnerius basato sul termine arn, "aquila", oppure da una forma aferetica del nome medioevale germanico Warneri.
Il cognome Arneri è tipicamente lombardo dell'area pavese, con un piccolo ceppo nel pavese. Arnero, quasi unico, è dell'alessandrino.
Il cognome Arneri è 12151° nella regione Lombardia Il cognome Arneri è 1389° nella provincia di Pavia Il cognome Arneri è 97° nel comune di VERRONE (BI)