Dovrebbe derivare da un soprannome basato sul fatto che il capostipite fosse un pescatore: l'agone è infatti un tipico pesce di lago e di fiume.
Il cognome Agoni è tipicamente lombardo, del bergamasco, del milanese e del bresciano. Agone è quasi unico.
Il cognome Agoni è 8515° nella regione Lombardia Il cognome Agoni è 1886° nella provincia di Bergamo Il cognome Agoni è 7° nel comune di SCHILPARIO (BG)