Potrebbe derivare dal cognomen latino Agathius oppure da un soprannome di origine greca basato sul termine agathos, "buono".
Il cognome Agate è siciliano, specifico del trapanese. Agatini è molto raro. Agatoni è quasi unico.
Il cognome Agatelli è 66115° nella regione Piemonte Il cognome Agatelli è 22278° nella provincia di Alessandria Il cognome Agatelli è 934° nel comune di BOVES (CN)